RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.68□□□□□ -1.5
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CSDE1-201ENST00000261443 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CSDE1-201ENST00000261443 A0A087WX48 190 aa5.66□□□□□ -1.5
CSDE1-201ENST00000261443 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.66□□□□□ -1.5
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CSDE1-201ENST00000261443 MDS2Q8NDY4 140 aa5.65□□□□□ -1.5
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CSDE1-201ENST00000261443 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 IGLC6P0CF74 106 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 A8MWV9 139 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 CEACAM4O75871 244 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 IGKV1-17P01599 117 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 KIR2DL4Q99706 377 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 FAM110AQ9BQ89 295 aa5.65□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 PROCRQ9UNN8 238 aa5.65□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 AKAP6Q13023 2319 aa5.64□□□□□ -1.51
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CSDE1-201ENST00000261443 M0R1B8 84 aa5.64□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.64□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 Q8TAT8 98 aa5.64□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 DKK4Q9UBT3 224 aa5.64□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 GAGE12JA6NER3 117 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 I3L2K1 104 aa5.63□□□□□ -1.51
CSDE1-201ENST00000261443 GAGE7O76087 117 aa5.63□□□□□ -1.51
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