RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SLC25A22Q9H936 323 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TREM1Q9NP99 234 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 VAX2Q9UIW0 290 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RFNGQ9Y644 331 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 A0A1W2PRE2 83 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 F6UZH7 168 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 K7EQD1 137 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TGOLN2O43493 480 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PDE6DO43924 150 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TRGV3P03979 118 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CRYBA1P05813 215 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ORM2P19652 201 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MEOX2P50222 304 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CCL20P78556 96 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF90Q03938 601 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TIGITQ495A1 244 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PATE2Q6UY27 113 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 GPR82Q96P67 336 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR51M1Q9H341 326 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C16orf95Q9H693 158 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF702PQ9H963 129 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 GNG13Q9P2W3 67 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PKDREJQ9NTG1 2253 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZZEF1O43149 2961 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 USF3Q68DE3 2245 aa3.04□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 F8W036 122 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 H3BRN7 92 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 K7EMT4 169 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 NDUFA4O00483 81 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF253O75346 499 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 NDUFA7O95182 113 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SNAPINO95295 136 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LY6G6DO95868 133 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 IGHV3-48P01763 117 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 IL4P05112 153 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SRP19P09132 144 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SFTA3P0C7M3 94 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 FOLR2P14207 255 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 NPPCP23582 126 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PSMB8P28062 276 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TPPP2P59282 170 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 KRTAP12-2P59991 146 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LYZP61626 148 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PDE6HQ13956 83 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MIR17HGQ75NE6 70 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SSX7Q7RTT5 188 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SVBPQ8N300 66 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR4F5Q8NH21 305 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR4F4Q96R69 305 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PAXXQ9BUH6 204 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RABAC1Q9UI14 185 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ABCA4P78363 2273 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PTPN13Q12923 2485 aa3.03□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LAMA5O15230 3695 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms