RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 TACC2O95359 2948 aa16.12■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa16.12■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 CIDEAO60543 219 aa16.12■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 MC5RP33032 325 aa16.12■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 H3BRN7 92 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 GAS8-AS1O95177 125 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 SAMD13Q5VXD3 122 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 SCNM1Q9BWG6 230 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 FAM215AQ9Y5M1 114 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 SH2D1AO60880 128 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 CD40P25942 277 aa16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 LOXP28300 417 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 TRAV17A0A0B4J275 112 aa16.1■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 SMIM17P0DL12 118 aa16.1■□□□□ 0.17
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PMS1-222ENST00000639501 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 FBXL15Q9H469 300 aa16.1■□□□□ 0.17
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PMS1-222ENST00000639501 SMIM13P0DJ93 91 aa16.09■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 CT45A10P0DMU9 189 aa16.09■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.09■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 CCL17Q92583 94 aa16.09■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.09■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 IGHV1-8P0DP01 117 aa16.09■□□□□ 0.17
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PMS1-222ENST00000639501 S4R3C0 116 aa16.09■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 PPIAL4EA0A075B759 164 aa16.08■□□□□ 0.17
PMS1-222ENST00000639501 PPIAL4FP0DN26 164 aa16.08■□□□□ 0.17
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PMS1-222ENST00000639501 C17orf100A8MU93 164 aa16.07■□□□□ 0.16
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PMS1-222ENST00000639501 C3orf36Q3SXR2 165 aa16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 K7EIM0 57 aa16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 TMEM155Q4W5P6 130 aa16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 K7EM74 188 aa16.06■□□□□ 0.16
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PMS1-222ENST00000639501 ODF1Q14990 250 aa16.06■□□□□ 0.16
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PMS1-222ENST00000639501 TWIST1Q15672 202 aa16.06■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 ADIPOQQ15848 244 aa16.06■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 ZNF562Q6V9R5 426 aa16.06■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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PMS1-222ENST00000639501 C16orf97H3BN30 126 aa16.04■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 LYPD1Q8N2G4 141 aa16.04■□□□□ 0.16
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PMS1-222ENST00000639501 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.03■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.03■□□□□ 0.16
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PMS1-222ENST00000639501 ZMAT4Q9H898 229 aa16.03■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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PMS1-222ENST00000639501 WFDC2Q14508 124 aa16.03■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.03■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 IGF2RP11717 2491 aa16.02■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 EVI2AP22794 236 aa16.02■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 HIGD1BQ9P298 99 aa16.02■□□□□ 0.16
PMS1-222ENST00000639501 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 NUP37Q8NFH4 326 aa16.02■□□□□ 0.15
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PMS1-222ENST00000639501 IGFL4Q6B9Z1 124 aa16.01■□□□□ 0.15
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PMS1-222ENST00000639501 IGLC6P0CF74 106 aa16■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 IGLV1-47P01700 117 aa16■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 MTURNQ8N3F0 131 aa16■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 PRR25Q96S07 402 aa16■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 AAMDCQ9H7C9 122 aa16■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 AGRNO00468 2067 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 CEACAM4O75871 244 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 PLGLAQ15195 96 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 CEND1Q8N111 149 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 FOXC2Q99958 501 aa15.99■□□□□ 0.15
PMS1-222ENST00000639501 MAP1LC3AQ9H492 121 aa15.99■□□□□ 0.15
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