RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637110.1

CLN3-257, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 565 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-257ENST00000637110 LINC01587Q99440 93 aa8.33□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 H3BQ15 152 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 SLC17A3O00476 420 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 IGLC2P0DOY2 106 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 H2BFSP57053 126 aa8.32□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 PRM2P04554 102 aa8.31□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.31□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.3□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 ATP5SQ99766 215 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 MBD2Q9UBB5 411 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 HSPB11Q9Y547 144 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 ALG5Q9Y673 324 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.28□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 DEFB130AP0DP74 79 aa8.28□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 LEPP41159 167 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 TAS2R60P59551 318 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN3-257ENST00000637110 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.28□□□□□ -1.08
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CLN3-257ENST00000637110 ZNF253O75346 499 aa8.27□□□□□ -1.09
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CLN3-257ENST00000637110 FCN2Q15485 313 aa8.27□□□□□ -1.09
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CLN3-257ENST00000637110 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.27□□□□□ -1.09
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CLN3-257ENST00000637110 LYRM9A8MSI8 78 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 H7BYZ3 331 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 OR10J4P0C629 311 aa8.26□□□□□ -1.09
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CLN3-257ENST00000637110 CT45A10P0DMU9 189 aa8.26□□□□□ -1.09
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CLN3-257ENST00000637110 OXA1LQ15070 435 aa8.26□□□□□ -1.09
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CLN3-257ENST00000637110 PDE6HQ13956 83 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 RNF141Q8WVD5 230 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 FAM210BQ96KR6 192 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.24□□□□□ -1.09
CLN3-257ENST00000637110 F5H768 121 aa8.24□□□□□ -1.09
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