RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 GAGE5Q13069 117 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 GAGE6Q13070 117 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 PATE2Q6UY27 113 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 GPR82Q96P67 336 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM213A2RRL7 107 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 C15orf61A6NNL5 157 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC179H3BU77 68 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 ID1P41134 155 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 FOXI1Q12951 378 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 NF1P21359 2839 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC3BP05452 202 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 PDPNQ86YL7 162 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 AMN1Q8IY45 258 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 PRO0461Q9UI25 63 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 OR11H12B2RN74 326 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf74Q32Q52 190 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 OR11H1Q8NG94 326 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 OR11H2Q8NH07 326 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 NPIPB3Q92617 1050 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 FXYD5Q96DB9 178 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 FBN2P35556 2912 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 PRSS1P07477 247 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 PRDX2P32119 198 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 CEND1Q8N111 149 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GUT8 65 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFS7O75251 213 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 RND1Q92730 232 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 PSMB2P49721 201 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 HIST1H4GQ99525 98 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM160Q9NX00 188 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 SORL1Q92673 2214 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRT-211ENST00000618610 H3BVH4 76 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 LY6HO94772 140 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 SPRY3O43610 288 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 GAS8-AS1O95177 125 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 RBP4P02753 201 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV1-16P04430 117 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CECR9P0C854 216 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 CD177Q8N6Q3 437 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MDS2Q8NDY4 140 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MLST8Q9BVC4 326 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PTPRBP23467 1997 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 E7EUB6 86 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 HBDP02042 147 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TNFRSF1AP19438 455 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PRTN3P24158 256 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 WDR31Q8NA23 367 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 FOXC2Q99958 501 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 HAX1O00165 279 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 NPYP01303 97 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 KLRD1Q13241 179 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 Q6AWC8 147 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZT83 130 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-211ENST00000618610 AJUBAQ96IF1 538 aa6.51□□□□□ -1.37
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