RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 CNTFRP26992 372 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 ASCL2Q99929 193 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 SMKR1H3BMG3 65 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 DPM2O94777 84 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 C12orf74Q32Q52 190 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 TMEM178BH3BS89 294 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 IGLV1-47P01700 117 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 RRN3P1Q2M238 152 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 TM4SF20Q53R12 229 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 Q8N8P6 123 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 PRR25Q96S07 402 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 RNF5Q99942 180 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 RNF125Q96EQ8 232 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 ZNF479Q96JC4 524 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 CTSZQ9UBR2 303 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 LEPP41159 167 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 PLGLAQ15195 96 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 TWIST1Q15672 202 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 MRAP2Q96G30 205 aa7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 IGHG4P01861 327 aa7.71□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.71□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.71□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 M0R3E3 92 aa7.71□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 TNFRSF6BO95407 300 aa7.71□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 RAB9AP51151 201 aa7.71□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 TCTAP57738 103 aa7.71□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 ARPC1AQ92747 370 aa7.71□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 C17orf100A8MU93 164 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 PRRG2O14669 202 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 CD59P13987 128 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 CDIP1Q9H305 208 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 LY6LH3BQJ8 138 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 GAS8-AS1O95177 125 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 TPPP3Q9BW30 176 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 KNTC1P50748 2209 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WX48 190 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 GAGE13Q4V321 117 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 PRSS33Q8NF86 280 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.7□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 F8W735 103 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 LAMTOR5O43504 91 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 NDUFB3O43676 98 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 RBP4P02753 201 aa7.69□□□□□ -1.18
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HCG18-242ENST00000602319 KLRD1Q13241 179 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 NRACQ8N912 160 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 H3BMG7 143 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 S100A7AQ86SG5 101 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.69□□□□□ -1.18
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HCG18-242ENST00000602319 FOXC2Q99958 501 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 TECTAO75443 2155 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 PLNP26678 52 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 SCGB2A2Q13296 93 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 ADIPOQQ15848 244 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 ETDBQ3ZM63 59 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.67□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.67□□□□□ -1.18
HCG18-242ENST00000602319 RBAKDNA6NC62 111 aa7.67□□□□□ -1.18
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