RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TNFRSF9Q07011 255 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R1AQ13522 171 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8WTZ3 238 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 S100ZQ8WXG8 99 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 U3KQK5 164 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 OR11H12B2RN74 326 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R2P9O14990 202 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 LYRM1O43325 122 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IFNA4P05014 189 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CD7P09564 240 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 NPPCP23582 126 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM29Q86T20 159 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 COQ8AQ8NI60 647 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 DTD1Q8TEA8 209 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10C1Q96KK4 312 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 GINS3Q9BRX5 216 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC32Q9BV29 185 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 RETNQ9HD89 108 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 BATF3Q9NR55 127 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SYNGR2O43760 224 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TCRBP04435 133 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 NPY1RP25929 384 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PAFAH1B2P68402 229 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 LYG2Q86SG7 212 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB125Q8N687 156 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 LYRM9A8MSI8 78 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 HBE1P02100 147 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 BTCP35070 178 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 DHRS2Q13268 280 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF846Q147U1 533 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 OR4C46A6NHA9 309 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAP1O75689 374 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1-17P01599 117 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLC1P0CG04 106 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 RD3LP0DJH9 198 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10J1P30954 320 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 RND2P52198 227 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 TMUB2Q71RG4 321 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 ACY3Q96HD9 319 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM8Q96KF7 97 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL26Q96S19 204 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 VSIRQ9H7M9 311 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 V9GYY9 64 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GW15 77 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 FABP1P07148 127 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 IAPPP10997 89 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 CRYBB3P26998 211 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 TCF24Q7RTU0 167 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC35E1Q96K37 410 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 PSENENQ9NZ42 101 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFP92A6NM28 416 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms