RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 CT45A10P0DMU9 189 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ORM2P19652 201 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 CBLN1P23435 193 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 MFAP4P55083 255 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 OR5I1Q13606 314 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 EBI3Q14213 229 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 KLK9Q2XQG4 91 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 FAM209BQ5JX69 171 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 MLST8Q9BVC4 326 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 PGPA6NDG6 321 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 GNG7O60262 68 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 IGLV2-8P01709 118 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 UTF1Q5T230 341 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ARPC1AQ92747 370 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 VAMP8Q9BV40 100 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 Q9H3A6 140 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 B4DSR2 109 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 H3BRN7 92 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 BMPR1BO00238 502 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SLC17A3O00476 420 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SERF1AO75920 110 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 GPX1P07203 203 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 PSG1P11464 419 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 MYOD1P15172 320 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 MFAP2P55001 183 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 LYZP61626 148 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 RIGQ13278 110 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 FXYD3Q14802 87 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 HCP5Q6MZN7 132 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 PATE2Q6UY27 113 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 Q86TA4 180 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 CFHR4Q92496 578 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 RNF125Q96EQ8 232 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 NUDT11Q96G61 164 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GUS0 222 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GXF2 115 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 HIGD1CA8MV81 97 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 M0R143 59 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 HSBP1O75506 76 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 FCN3O75636 299 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 HLA-DRB1P01911 266 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 PYYP10082 97 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 COX7A1P24310 79 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 AMTP48728 403 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 UBE2E1P51965 193 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 GATD1Q8NB37 220 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 C14orf144Q96I85 54 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 NEU1Q99519 415 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 FBXL15Q9H469 300 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 RBAKDNA6NC62 111 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 E7EUB6 86 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 K7EIM0 57 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 CHEK1O14757 476 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 BRI3O95415 125 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1-17P01599 117 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 IGLC2P0DOY2 106 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 COL8A2P25067 703 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SRIP30626 198 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 BMI1P35226 326 aa6.28□□□□□ -1.4
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