RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 LINC00052Q96N35 136 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 PGPA6NDG6 321 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 M0R3E3 92 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 PAGE4O60829 102 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 IFNA1P01562 189 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 HLA-DMBP28068 263 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 GNG13Q9P2W3 67 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 RBAKDNA6NC62 111 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 BCL2P10415 239 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 CSN1S1P47710 185 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 UBE2G2P60604 165 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 ZNF738Q8NE65 137 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 FAM210AQ96ND0 272 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 PRR25Q96S07 402 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 EPDR1Q9UM22 224 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 AGRNO00468 2067 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 A0A0J9YX75 114 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 A8MTW9 85 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 A8MZ25 164 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 DIRC3C9JPN6 131 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 HLA-DRB4P13762 266 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 CST9LP1Q5W188 147 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 VAX2Q9UIW0 290 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 C11orf94C9JXX5 98 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 PRAC2D3DTV9 90 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TCRAP04437 139 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ATP5G3P48201 142 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 CITED4Q96RK1 184 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 MED9Q9NWA0 146 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 F6UB75 175 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 F6UZH7 168 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 H3BMM0 161 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 PDE6DO43924 150 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ZNF124Q15973 351 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 HAGHQ16775 308 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 DEFB125Q8N687 156 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 C11orf52Q96A22 123 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 LINC00477Q96M19 166 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ATG101Q9BSB4 218 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 KNCNA6PVL3 124 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 K7EQM0 130 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 PEX7O00628 323 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 DEFB1P60022 68 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 GNG5P63218 68 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 STHQ8IWL8 128 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 RARRES2Q99969 163 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 RAB19A4D1S5 217 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TMEM250H0YL14 139 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TOR2AQ5JU69 321 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 AMTNQ6UX39 209 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 ODF3Q96PU9 254 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 VGLL1Q99990 258 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-211ENST00000582232 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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