RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579358.1

MKS1-208, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 4

Gene MKS1, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-208ENST00000579358 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 LINC01559Q495D7 138 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 Q8NAQ8 132 aa7.29□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 X6R8D5 127 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 STAG3L2P0CL84 134 aa7.28□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 STAG3L3P0CL85 134 aa7.28□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 FXYD7P58549 80 aa7.28□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.28□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 ODF3Q96PU9 254 aa7.28□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 M0R3E3 92 aa7.27□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 BCL2L11O43521 198 aa7.27□□□□□ -1.25
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MKS1-208ENST00000579358 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.27□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.27□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 RAB24Q969Q5 203 aa7.27□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.27□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.27□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 M0R2Z0 102 aa7.26□□□□□ -1.25
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MKS1-208ENST00000579358 CDKN1BP46527 198 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 CASC10Q5T4H9 136 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 Q9H3A6 140 aa7.26□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TMEM189A5PLL7 270 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 RBAKDNA6NC62 111 aa7.25□□□□□ -1.25
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MKS1-208ENST00000579358 CXorf1O96002 111 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 C1QBP02746 253 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 SEC11BP0C7V7 166 aa7.25□□□□□ -1.25
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MKS1-208ENST00000579358 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 CSN1S1P47710 185 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 RANP62826 216 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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MKS1-208ENST00000579358 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 AKAP14Q86UN6 197 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 BAP18Q8IXM2 172 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 SUN5Q8TC36 379 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 LINC00477Q96M19 166 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 OTORQ9NRC9 128 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.25□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TENM3Q9P273 2699 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
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MKS1-208ENST00000579358 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 GCHFRP30047 84 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 LEPP41159 167 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 ZNF726P1Q15940 193 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TMUB2Q71RG4 321 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 HYLS1Q96M11 299 aa7.24□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 UMAD1C9J7I0 102 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 DEFB4AO15263 64 aa7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MKS1-208ENST00000579358 CT45A10P0DMU9 189 aa7.23□□□□□ -1.25
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