RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ABCA1O95477 2261 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 H3BRN7 92 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 DUX5Q96PT3 197 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 FAM168AQ92567 244 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 PSMB11A5LHX3 300 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 KLRB1Q12918 225 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 THBDP07204 575 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 LYNX1P0DP58 116 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 PRR25Q96S07 402 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 IGLC1P0CG04 106 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV2-14P01704 120 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 IGHV4-39P01824 125 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 CD28P10747 220 aa8.29□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 CSTL1Q9H114 145 aa8.29□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 DUX3Q96PT4 197 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3-11P01762 117 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 ATP5J2P56134 94 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 Q9UFV3 132 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM141Q96I45 108 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-205ENST00000577827 USMG5Q96IX5 58 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZVH6 145 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-205ENST00000577827 K7EMI3 77 aa8.26□□□□□ -1.09
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