RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577435.5

GGA3-203, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-203ENST00000577435 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 FUT9Q9Y231 359 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 PRELID1Q9Y255 219 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 HYDINQ4G0P3 5121 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 PRAC2D3DTV9 90 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 PYYP10082 97 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 RRN3P1Q2M238 152 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 C12orf74Q32Q52 190 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 C2CD4CQ8TF44 421 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 LINC00476Q8WZB0 136 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 AQP10Q96PS8 301 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 OR51M1Q9H341 326 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 CELA1Q9UNI1 258 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 NBEAP1P0C6P0 100 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 SPART-AS1P0CW21 52 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 CDKN1BP46527 198 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 Q5BKY6 102 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 FFAR4Q5NUL3 377 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 Q6ZTC4 211 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 BAP18Q8IXM2 172 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TMEM256Q8N2U0 113 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 ODF3Q96PU9 254 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 C20orf144Q9BQM9 153 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TMEM208Q9BTX3 173 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 DKK2Q9UBU2 259 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TSPOP30536 169 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 FXYD5Q96DB9 178 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 PAXXQ9BUH6 204 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 M0R3E3 92 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 CT45A10P0DMU9 189 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TAS2R60P59551 318 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 ZNF266Q14584 549 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 BLNKQ8WV28 456 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 RNF141Q8WVD5 230 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 ZNF503Q96F45 646 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 LINC00477Q96M19 166 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 M6PRP20645 277 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 EMP1P54849 157 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 TAS2R45P59539 299 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 LINC01587Q99440 93 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 APLNQ9ULZ1 77 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-203ENST00000577435 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 H7BYZ3 331 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 OR7C2O60412 319 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 OR10J4P0C629 311 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 ICAM4Q14773 271 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 KHDC3LQ587J8 217 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 LYRM9A8MSI8 78 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 IGLL5B9A064 214 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 LY6G6CO95867 125 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 PRM2P04554 102 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 NMBP08949 121 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 AZU1P20160 251 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 LEPP41159 167 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 KIR3DS1Q14943 382 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 KMT2AQ03164 3969 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 A0A1W2PPV4 95 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 RNF222A6NCQ9 220 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 G3V3Q6 166 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 SERF2P84101 59 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.94□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 KLLNB2CW77 178 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 MBP02144 154 aa9.93□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
GGA3-203ENST00000577435 CRISP2P16562 243 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms