RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 GATCO43716 136 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 SRD5A1P18405 259 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR27Q6MZM9 219 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFP82Q8N141 532 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDT10Q8NFP7 164 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDT11Q96G61 164 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TM4SF20Q53R12 229 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 LCN12Q6JVE5 192 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 C8orf86Q6ZUL3 223 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGFL4Q6B9Z1 124 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMPXQ9UHP9 88 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 BMI1P35226 326 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 LY6G6DO95868 133 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 HLA-DMBP28068 263 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMR3AQ99954 134 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 REC114Q7Z4M0 266 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBAKDNA6NC62 111 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 C19orf71A6NCJ1 209 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRGC2P03986 189 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPL19P84098 196 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 LGALS9O00182 355 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 GBGT1Q8N5D6 347 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 C16orf92Q96LL3 132 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 SONP18583 2426 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A087WW49 117 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 A8MWP6 167 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 P01737 135 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 HILS1P60008 231 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF182Q8N6D2 247 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 CT83Q5H943 113 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 NRN1Q9NPD7 142 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACANP16112 2415 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1-208ENST00000573600 S100A6P06703 90 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4B1Q8NGF8 309 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 C4orf3Q8WVX3 66 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 WFDC12Q8WWY7 111 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 C16orf95Q9H693 158 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYO9AB2RTY4 2548 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TSKUQ8WUA8 353 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 JMJD8Q96S16 334 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CT45A10P0DMU9 189 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 VGLL1Q99990 258 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPIPB6E9PJ23 425 aa22.11■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR25Q96S07 402 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 A8MWL6 223 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOCS3O14543 225 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 CA1P00915 261 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDFIP1Q9BT67 221 aa22.11■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAC2D3DTV9 90 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHOX2AO14813 284 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ACTL10Q5JWF8 245 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC01619G3V211 115 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOSL1P15407 271 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCL1AP56279 114 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCF24Q7RTU0 167 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 FRZBQ92765 325 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 C8orf49Q96NF6 230 aa22.09■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 COX19Q49B96 90 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q71RC1 249 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASCL2Q99929 193 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 GFRA4Q9GZZ7 299 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BKO60814 126 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BJP06899 126 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRGC1P0CF51 173 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BOP23527 126 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BBP33778 126 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BDP58876 126 aa22.07■■□□□ 1.12
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