RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 KIR3DS1Q14943 382 aa14.77□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 ATG101Q9BSB4 218 aa14.77□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.77□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 H7BYZ3 331 aa14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 J3KRW8 73 aa14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 ATP5G1P05496 136 aa14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 FGF7P21781 194 aa14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 ATP5G3P48201 142 aa14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 GUK1Q16774 197 aa14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 VWC2Q2TAL6 325 aa14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.76□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 DNAH2Q9P225 4427 aa14.75□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 NUDT3O95989 172 aa14.75□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 IL15RAQ13261 267 aa14.75□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.75□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 S100ZQ8WXG8 99 aa14.75□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.75□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 CBY3A6NI87 242 aa14.74□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 ATP6V1FQ16864 119 aa14.74□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.74□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.74□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.74□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1B0GVY2 172 aa14.73□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 ASAH1Q13510 395 aa14.73□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 Q6ZR54 194 aa14.73□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 ENKURQ8TC29 256 aa14.73□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 LEPP41159 167 aa14.72□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.72□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.72□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.71□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 SIX6O95475 246 aa14.71□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 CT45A10P0DMU9 189 aa14.71□□□□□ -0.05
PPP4C-211ENST00000567642 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.71□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 HERC2O95714 4834 aa14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF253O75346 499 aa14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 MPDU1O75352 247 aa14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 RLN2P04090 185 aa14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 NHLH2Q02577 135 aa14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.7□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 SNURFLB1AK76 121 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 PYYP10082 97 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 THAP6Q8TBB0 222 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 BLNKQ8WV28 456 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 ODF3Q96PU9 254 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.69□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 M0R3E3 92 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 CCL18P55774 89 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 ERCC8Q13216 396 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 OR5I1Q13606 314 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 RNF141Q8WVD5 230 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.68□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 GAGE12BA1L429 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 E5RGE8 158 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 UPK1BO75841 260 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 GAGE7O76087 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 GAGE12FP0CL80 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 GAGE12GP0CL81 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 GAGE12IP0CL82 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 CLINT1Q14677 625 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 PRELID1Q9Y255 219 aa14.67□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 NDUFB4O95168 129 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 NMES1Q9C002 83 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.66□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 PDE6HQ13956 83 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.65□□□□□ -0.06
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 C7orf71A4D174 169 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 ICAM4Q14773 271 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 LINC00477Q96M19 166 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.64□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 A0A0J9YY99 117 aa14.63□□□□□ -0.07
PPP4C-211ENST00000567642 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms