RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 J3KRW8 73 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 CCR6P51684 374 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 CRYBA4P53673 196 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52I2Q8NH67 350 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 FUT9Q9Y231 359 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 LRP2P98164 4655 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 TNXBP22105 4242 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 RNF213Q63HN8 5207 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 PRAC2D3DTV9 90 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 LYRM1O43325 122 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 PSCAO43653 123 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SPINK4O60575 86 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 HPGDSO60760 199 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 IGHV3-53P01767 116 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 CRYGDP07320 174 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 RAB11AP62491 216 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 FHL2Q14192 279 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SMCO1Q147U7 214 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 LRRC20Q8TCA0 184 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 PRO0255Q9UI72 69 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 GPR132Q9UNW8 380 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 K7EQD1 137 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 RAB3DO95716 219 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 CT45A10P0DMU9 189 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 S100A7P31151 101 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SCXQ7RTU7 201 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 AKAP14Q86UN6 197 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 OR1S1Q8NH92 325 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 C8orf49Q96NF6 230 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0B4J2A0 478 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 IAPPP10997 89 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 RAP2BP61225 183 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SLAQ13239 276 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 TEPPQ6URK8 271 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 MCUBQ9NWR8 336 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 E5RGE8 158 aa5.92□□□□□ -1.46
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RABGGTA-217ENST00000560521 HYPMO75409 117 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5G3P0C626 314 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 TAS2R19P59542 299 aa5.92□□□□□ -1.46
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RABGGTA-217ENST00000560521 IFITM3Q01628 133 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 WFDC2Q14508 124 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 BAK1Q16611 211 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 PATE2Q6UY27 113 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 LRTM2Q8N967 370 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 TRIM63Q969Q1 353 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC17A3O00476 420 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 IL5P05113 134 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 AKAIN1P0CW23 69 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 MT1HL1P0DM35 61 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 AKR1C4P17516 323 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTA-217ENST00000560521 CXCL2P19875 107 aa5.91□□□□□ -1.46
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