RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 RRN3P1Q2M238 152 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 BAP18Q8IXM2 172 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR51M1Q9H341 326 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 FUT9Q9Y231 359 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRELID1Q9Y255 219 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TENM2Q9NT68 2774 aa8.91□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 RYR3Q15413 4870 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRAC2D3DTV9 90 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 NDUFB4O95168 129 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TSPOP30536 169 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDKN1BP46527 198 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q6ZTC4 211 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 AQP10Q96PS8 301 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 PAXXQ9BUH6 204 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 CELA1Q9UNI1 258 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-205ENST00000560067 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR7C2O60412 319 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 LY6G6CO95867 125 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAS2R45P59539 299 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF266Q14584 549 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 C12orf74Q32Q52 190 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q5BKY6 102 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF141Q8WVD5 230 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINC01587Q99440 93 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGLL5B9A064 214 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 M0R3E3 92 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR10J4P0C629 311 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ICAM4Q14773 271 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 KHDC3LQ587J8 217 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 FXYD5Q96DB9 178 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 DKK2Q9UBU2 259 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1W2PPV4 95 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 CT45A10P0DMU9 189 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 HTN1P15515 57 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 M6PRP20645 277 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 LEPP41159 167 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 TCTAP57738 103 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAS2R60P59551 318 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ODF3Q96PU9 254 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRM2P04554 102 aa8.86□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERCC8Q13216 396 aa8.86□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.86□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.86□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINC00477Q96M19 166 aa8.86□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.86□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 H7BYZ3 331 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 J3KRW8 73 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 CSN1S1P47710 185 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB2AP61019 212 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 RANP62826 216 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF503Q96F45 646 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 RYR2Q92736 4967 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 MBP02144 154 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 AZU1P20160 251 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP6V0CP27449 155 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 DAD1P61803 113 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIR3DS1Q14943 382 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 C16orf74Q96GX8 76 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q9H3A6 140 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms