RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 SPINT2O43291 252 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 PLAUP00749 431 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 IGKV1D-12P01611 117 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ELANEP08246 267 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 PLNP26678 52 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 C5orf63A6NC05 138 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 C15orf61A6NNL5 157 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 M0R135 149 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 SLC25A16P16260 332 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 LEPP41159 167 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 PMAIP1Q13794 54 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 BORCS8Q96FH0 119 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 COX14Q96I36 57 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 RNF186Q9NXI6 227 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 A0A0G2JNJ9 132 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 OVOL3O00110 214 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 AVPP01185 164 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 CDAP32320 146 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ORMDL3Q8N138 153 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 C1orf159Q96HA4 380 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 METTL26Q96S19 204 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 Q9UFV3 132 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 CXCL13O43927 109 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 PRSS1P07477 247 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ERVK-16P61578 105 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 SFTA2Q6UW10 78 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ZNF329Q86UD4 541 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 STHQ8IWL8 128 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 UPK2O00526 184 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 CCL11P51671 97 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 Q8N8P6 123 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ZNF524Q96C55 264 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 C16orf92Q96LL3 132 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 CCL16O15467 120 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 FCGR3BO75015 233 aa6.61□□□□□ -1.35
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USP3-211ENST00000559257 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 GFERP55789 205 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 LOXL3P58215 753 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.61□□□□□ -1.35
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USP3-211ENST00000559257 Q96MF0 132 aa6.61□□□□□ -1.35
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USP3-211ENST00000559257 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 A0A1W2PQU0 124 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 COPS9Q8WXC6 57 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 FOXC2Q99958 501 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 D6R8Y8 96 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP3-211ENST00000559257 CFC1P0CG37 223 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 DEFB134Q4QY38 66 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 C2orf82Q6UX34 121 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 MKXQ8IYA7 352 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 FMC1Q96HJ9 113 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 CCL26Q9Y258 94 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 A0A0U1RQV1 116 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP3-211ENST00000559257 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP3-211ENST00000559257 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP3-211ENST00000559257 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 LINC00596Q86U02 117 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 BRK1Q8WUW1 75 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 C17orf100A8MU93 164 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 LYZL6O75951 148 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 FGF12P61328 243 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.58□□□□□ -1.36
USP3-211ENST00000559257 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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