RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.78□□□□□ -0.84
PCNX4-209ENST00000555569 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PCNX4-209ENST00000555569 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.77□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 PRAC2D3DTV9 90 aa9.77□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 GUK1Q16774 197 aa9.77□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.77□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 NACAE9PAV3 2078 aa9.77□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 A6NHS1 94 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 MPDU1O75352 247 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 SIX6O95475 246 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 DEFB130BP0DP73 79 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 DEFB130AP0DP74 79 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 HTN1P15515 57 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 FCN2Q15485 313 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 C16orf74Q96GX8 76 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.76□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 H7BYZ3 331 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 M0R2N4 97 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF253O75346 499 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 RLN2P04090 185 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 IFITM3Q01628 133 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 NHLH2Q02577 135 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 NMES1Q9C002 83 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.75□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 E5RGE8 158 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 PRAF2O60831 178 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 KIR3DS1Q14943 382 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 RNF212Q495C1 297 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 F5H768 121 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 ATP5G1P05496 136 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 LEPP41159 167 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 ATP5G3P48201 142 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 THAP6Q8TBB0 222 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 ODF3Q96PU9 254 aa9.73□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 CBY3A6NI87 242 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 H0YIZ8 118 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 J3KRW8 73 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 CT45A10P0DMU9 189 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 PYYP10082 97 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 CLINT1Q14677 625 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 PRELID1Q9Y255 219 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.72□□□□□ -0.85
PCNX4-209ENST00000555569 M0R3E3 92 aa9.71□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 NDUFB4O95168 129 aa9.71□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 PDE6HQ13956 83 aa9.71□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 BLNKQ8WV28 456 aa9.71□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.71□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.7□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 RTL8CO15255 209 aa9.7□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 Q6ZR54 194 aa9.7□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 ATG101Q9BSB4 218 aa9.7□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.7□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.7□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 NUDT3O95989 172 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 H2BFSP57053 126 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 DEFA1P59665 94 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 DEFA3P59666 94 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 ERCC8Q13216 396 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 LINC00477Q96M19 166 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.69□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.68□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 A0A1B0GVY2 172 aa9.68□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 C7orf71A4D174 169 aa9.68□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 SNURFLB1AK76 121 aa9.68□□□□□ -0.86
PCNX4-209ENST00000555569 SSNA1O43805 119 aa9.68□□□□□ -0.86
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