RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 ALPK3Q96L96 1907 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 MCRIP1C9JLW8 97 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 SLC25A4P12235 298 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CCL4P13236 92 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 FXYD2P54710 66 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 Q5W150 140 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 OR4X2Q8NGF9 303 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 LCN9Q8WX39 176 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 AQP3Q92482 292 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 DPY30Q9C005 99 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TNFRSF19Q9NS68 423 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 FKBP11Q9NYL4 201 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 HEATR5AQ86XA9 2040 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 C17orf98A8MV24 154 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TMEM262E9PQX1 116 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 K7EM74 188 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 M0R2P5 195 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TRACP01848 142 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CISD3P0C7P0 127 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 LINC00032P0C843 101 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CRYGAP11844 174 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CKS2P33552 79 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 ETV6P41212 452 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 SS18Q15532 418 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 C2orf83Q53S99 150 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 Q6AWC8 147 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 OR5AK2Q8NH90 309 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CCL4L1Q8NHW4 92 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 UBALD1Q8TB05 177 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CLEC2BQ92478 149 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 PSMF1Q92530 271 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 VAMP8Q9BV40 100 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 THADAQ6YHU6 1953 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 MAP3K1Q13233 1512 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TEX14Q8IWB6 1497 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 FYCO1Q9BQS8 1478 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PRS3 328 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 C7orf66A4D0T2 115 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 H7C2G1 150 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 ZNF737O75373 536 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 COL8A2P25067 703 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 PYY3Q5JQD4 70 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 Q8N2B8 174 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 Q8NDZ9 215 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 OTOSQ8NHW6 89 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 FAM215AQ9Y5M1 114 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 TRPM6Q9BX84 2022 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
CS-232ENST00000552331 SCN9AQ15858 1988 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 SCN4AP35499 1836 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 A0A087WYN8 130 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 FAM24AA6NFZ4 105 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 H3BQF6 201 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 SHBGP04278 402 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 NPC2P61916 151 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 ESRGQ1W209 222 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 C6orf52Q5T4I8 152 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 FAM27BQ5VT28 67 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 MIC13Q5XKP0 118 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 OR2T2Q6IF00 324 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 Q6ZS52 159 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 SLC35E3Q7Z769 313 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 LINC00471Q8N535 108 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 HYLS1Q96M11 299 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 ARHGAP5Q13017 1502 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 PLXNA3P51805 1871 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 WDR90Q96KV7 1748 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 DOCK9Q9BZ29 2069 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-232ENST00000552331 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms