RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	IFNA7	P01567	189 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	PYY	P10082	97 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ZNF124	Q15973	351 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	NDUFA5	Q16718	116 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	GUK1	Q16774	197 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222		Q6ZWC4	215 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PPV4	95 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	SEC11B	P0C7V7	166 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	TAS2R45	P59539	299 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	BAP18	Q8IXM2	172 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222		H3BTX0	84 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	SLC17A3	O00476	420 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	OR7C2	O60412	319 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	RNF141	Q8WVD5	230 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	AGRN	O00468	2067 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	KNCN	A6PVL3	124 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ZNF253	O75346	499 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	NDUFB4	O95168	129 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	OR10J4	P0C629	311 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	PDE6H	Q13956	83 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	RAB24	Q969Q5	203 aa		10	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	STAG3L2	P0CL84	134 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	STAG3L3	P0CL85	134 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	HLA-DMB	P28068	263 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	DEFB1	P60022	68 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ZNF726P1	Q15940	193 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	PSG3	Q16557	428 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	SSX7	Q7RTT5	188 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	BLNK	Q8WV28	456 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	TMED6	Q8WW62	240 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	UMAD1	C9J7I0	102 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222		H3BMM0	161 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	HLA-DRB4	P13762	266 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	APOC4	P55056	127 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	STH	Q8IWL8	128 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222		A0A0J9YX75	114 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	FHIT	P49789	147 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	PSG9	Q00887	426 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	CLLU1	Q5K131	121 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	ZNF738	Q8NE65	137 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	SUN5	Q8TC36	379 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.81
CS-231	ENST00000552222	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CS-231	ENST00000552222		F6UB75	175 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CS-231	ENST00000552222	CXorf1	O96002	111 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CS-231	ENST00000552222	GCHFR	P30047	84 aa		9.96	□□□□□ -0.82
CS-231	ENST00000552222	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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