RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	CENPW	Q5EE01	88 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	OSTC	Q9NRP0	149 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984		K7EQM0	130 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	SNAI2	O43623	268 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	APOA2	P02652	100 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	GNG4	P50150	75 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	BLNK	Q8WV28	456 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	NOTCH1	P46531	2555 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	TG	P01266	2768 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1W2PPM0	123 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984		A6NDN8	102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	COX8A	P10176	69 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	EDDM3A	Q14507	147 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984		Q6P435	159 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	MRAP2	Q96G30	205 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	ISLR	O14498	428 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	OR2H2	O95918	312 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	HBZ	P02008	142 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	GCHFR	P30047	84 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FGD4-215	ENST00000551984	HELT	A6NFD8	242 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR2J3	O76001	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	LEPROTL1	O95214	131 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TSPAN13	O95857	204 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	RASL11A	Q6T310	242 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM219	Q86XT9	240 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV1-47	P01700	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV2-8	P01709	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984		P0C879	139 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OPRK1	P41145	380 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	MFAP2	P55001	183 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	SPINK9	Q5DT21	86 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	MIC13	Q5XKP0	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	COQ2	Q96H96	371 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	C15orf62	A8K5M9	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CGB3	P0DN86	165 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CGB7	P0DN87	165 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CD28	P10747	220 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FGF6	P10767	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	AREG	P15514	252 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	G6PC	P35575	357 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	LTC4S	Q16873	150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms