RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551901.5

RRN3P1-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RRN3P1, Length 1,157 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-204ENST00000551901 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 APLNQ9ULZ1 77 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 HSPB11Q9Y547 144 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 RFNGQ9Y644 331 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 ALG5Q9Y673 324 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 NDUFB4O95168 129 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 ATP5SQ99766 215 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 DKK2Q9UBU2 259 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 LY6G6CO95867 125 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 HBE1P02100 147 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 PRM2P04554 102 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 PET100P0DJ07 73 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 RRN3P1Q2M238 152 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 BAP18Q8IXM2 172 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 MBD2Q9UBB5 411 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 KMT2AQ03164 3969 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 IGLL5B9A064 214 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 INSP01308 110 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 PYYP10082 97 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 TSPOP30536 169 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 CDKN1BP46527 198 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 RHOBP62745 196 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 PDE6HQ13956 83 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 OXA1LQ15070 435 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 FCN2Q15485 313 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 WFDC1Q9HC57 220 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 M0R3E3 92 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 CT45A10P0DMU9 189 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 AZU1P20160 251 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 EMP1P54849 157 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 KIR3DS1Q14943 382 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF503Q96F45 646 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 ODF3Q96PU9 254 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 OR51M1Q9H341 326 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-204ENST00000551901 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 TAS2R60P59551 318 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 Q5BKY6 102 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 FXYD5Q96DB9 178 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 MED28Q9H204 178 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 FUT9Q9Y231 359 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 PRELID1Q9Y255 219 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 IFNA5P01569 189 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 BLNKQ8WV28 456 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 AQP10Q96PS8 301 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 LINC01587Q99440 93 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 PAXXQ9BUH6 204 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 LYRM9A8MSI8 78 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 H7BYZ3 331 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 ERCC8Q13216 396 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 ICAM4Q14773 271 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 ASB13Q8WXK3 278 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM210BQ96KR6 192 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms