RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-228ENST00000551473 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-228ENST00000551473 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 WRBO00258 174 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 SYNGR2O43760 224 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 SPINK4O60575 86 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 TCL1AP56279 114 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 NCS1P62166 190 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 C4orf46Q504U0 113 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 LRTM2Q8N967 370 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 VGLL1Q99990 258 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 VBP1P61758 197 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 ARL6Q9H0F7 186 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 ARV1Q9H2C2 271 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 A0A087WXM4 84 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 C7orf71A4D174 169 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 PRAF2O60831 178 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 IGHV3-53P01767 116 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 ORM1P02763 201 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 CT45A10P0DMU9 189 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 TEPPQ6URK8 271 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 C8orf49Q96NF6 230 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 RABL2BQ9UNT1 228 aa8□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 PRAC2D3DTV9 90 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 K7EQD1 137 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 ZNF415Q09FC8 603 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 GUK1Q16774 197 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 Q6ZSA8 131 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 E5RGE8 158 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 FNDC10F2Z333 226 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 H3BP45 60 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 K7EPK0 472 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 CTDSPLO15194 276 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 MPDU1O75352 247 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 FHL2Q14192 279 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 TDRG1Q3Y452 100 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 ZNF546Q86UE3 836 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 KLLNB2CW77 178 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 GOSR2O14653 212 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 RGS13O14921 159 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 RGS5O15539 181 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 ASAH1Q13510 395 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 PATE2Q6UY27 113 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 MCUBQ9NWR8 336 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-228ENST00000551473 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 C9JCJ5 164 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 SLC17A3O00476 420 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 COX7A2P2O60397 106 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 ZNF253O75346 499 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 IGLC2P0DOY2 106 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 GYPEP15421 78 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 IL18Q14116 193 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 LINC00477Q96M19 166 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 TM2D2Q9BX73 214 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 PSENENQ9NZ42 101 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 GPX1P07203 203 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 NMBP08949 121 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 OR4E1P0C645 316 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 VAMP1P23763 118 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 TIRAPP58753 221 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 BTN1A1Q13410 526 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-228ENST00000551473 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.94□□□□□ -1.14
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