RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 H3BQ15 152 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 M0R2N4 97 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 UPK1BO75841 260 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 SIX6O95475 246 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 TSPOP30536 169 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 NHLH2Q02577 135 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 IL15RAQ13261 267 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 GUK1Q16774 197 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 VWC2Q2TAL6 325 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 LYRM9A8MSI8 78 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PRAC2D3DTV9 90 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 F5H768 121 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 J3KRW8 73 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 SLC17A3O00476 420 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 IGLC2P0DOY2 106 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R60P59551 318 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 C16orf74Q96GX8 76 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 A6NHS1 94 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 E5RGE8 158 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 H7BYZ3 331 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 MPDU1O75352 247 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 KIR3DS1Q14943 382 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 THAP6Q8TBB0 222 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 BLNKQ8WV28 456 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 NMES1Q9C002 83 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 CBY3A6NI87 242 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 SSNA1O43805 119 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PRAF2O60831 178 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 NUDT3O95989 172 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ATP5G1P05496 136 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 LEPP41159 167 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ATP5G3P48201 142 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 DEFA1P59665 94 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 DEFA3P59666 94 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 IFITM3Q01628 133 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 CLINT1Q14677 625 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 RNF212Q495C1 297 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ATG101Q9BSB4 218 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 CT45A10P0DMU9 189 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PYYP10082 97 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PRELID1Q9Y255 219 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 SNURFLB1AK76 121 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 H0YIZ8 118 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 M0R3E3 92 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ZNF253O75346 499 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ERCC8Q13216 396 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 OR5I1Q13606 314 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 ICAM4Q14773 271 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 LINC00477Q96M19 166 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 OR51M1Q9H341 326 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 A0A1B0GVY2 172 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 GAGE12BA1L429 117 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 GAGE7O76087 117 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-222ENST00000540445 NDUFB4O95168 129 aa6.34□□□□□ -1.39
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