RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610		K7EN84	100 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610		A0A087WW49	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	LGALS9	O00182	355 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	IMMP2L	Q96T52	175 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	LINC01619	G3V211	115 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610		M0R3E3	92 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	LTA	P01374	205 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	OR5I1	Q13606	314 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	ELOB	Q15370	118 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	PSG3	Q16557	428 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	CHEK1	O14757	476 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	TCF21	O43680	179 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	NDUFA7	O95182	113 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	LCN12	Q6JVE5	192 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ATG13-222	ENST00000534610		M0QZ24	198 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RAB5A	P20339	215 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610		Q86TA4	180 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ANK2	Q01484	3957 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610		A8MWP6	167 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	NRN1	Q9NPD7	142 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	FOXL1	Q12952	345 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PRR27	Q6MZM9	219 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PEMT	Q9UBM1	199 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RBAKDN	A6NC62	111 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	HAX1	O00165	279 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	FOLR2	P14207	255 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ID1	P41134	155 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MLX	Q9UH92	298 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	CXCL1	P09341	107 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610		V9GYV3	84 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG13-222	ENST00000534610	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54

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