RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF266Q14584 549 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 BAP18Q8IXM2 172 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PAXXQ9BUH6 204 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 X6R8D5 127 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PPV4 95 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 NUPR2A6NF83 97 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 TAS2R45P59539 299 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB2AP61019 212 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 KHDC3LQ587J8 217 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8NAQ8 132 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 AQP10Q96PS8 301 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 OR51M1Q9H341 326 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RFNGQ9Y644 331 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PRAC2D3DTV9 90 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 SMLR1H3BR10 107 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 J3KRW8 73 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ARPC5O15511 151 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 HBE1P02100 147 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 AMBPP02760 352 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 AMTNQ6UX39 209 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 M0R3E3 92 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 JTBO76095 146 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 HTN1P15515 57 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PDE6HQ13956 83 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ICAM4Q14773 271 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF141Q8WVD5 230 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF253O75346 499 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 M6PRP20645 277 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP6V0CP27449 155 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 TSPOP30536 169 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RANP62826 216 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RRN3P1Q2M238 152 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 FXYD5Q96DB9 178 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC01587Q99440 93 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 TENM2Q9NT68 2774 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF222A6NCQ9 220 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 A8MTW9 85 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFB4O95168 129 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 LEPP41159 167 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 CDKN1BP46527 198 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 CSN1S1P47710 185 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 HYLS1Q96M11 299 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 CELA1Q9UNI1 258 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 PRELID1Q9Y255 219 aa8.27□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM189A5PLL7 270 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 ERCC8Q13216 396 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 NEU1Q99519 415 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE6AA0A183 80 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-208ENST00000533451 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.25□□□□□ -1.09
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