RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530170.1

RPS3-215, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 531 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-215ENST00000530170 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 VWC2LB2RUY7 222 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 DIRC3C9JPN6 131 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 M0R143 59 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 OVOL3O00110 214 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 OR5AL1P0C617 328 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 FAM106CPP0CH98 169 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 TMEM11P17152 192 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 TNP2Q05952 138 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 KLRD1Q13241 179 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 RIGQ13278 110 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 TM4SF20Q53R12 229 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 PRR27Q6MZM9 219 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 Q8N9W7 124 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 GTSF1Q8WW33 167 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 PSG8Q9UQ74 426 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 A0A1B0GUT8 65 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 A0A1W2PRD5 423 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 A0A1W2PRF3 423 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 A0A1W2PRM7 423 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 RBAKDNA6NC62 111 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 HSBP1O75506 76 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 CSN1S1P47710 185 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 DLX1P56177 255 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 C3orf79P0CE67 100 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 CT45A10P0DMU9 189 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 CDKN1AP38936 164 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 LMO4P61968 165 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 SLC35B1P78383 322 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 HES1Q14469 280 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 LEMD1Q68G75 181 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 BORCS7Q96B45 105 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 AJUBAQ96IF1 538 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 CNFNQ9BYD5 112 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 RABAC1Q9UI14 185 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-215ENST00000530170 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 A0A1W2PPR1 153 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 ZNF785A8K8V0 405 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 NDUFS8O00217 210 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 WIPF1O43516 503 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 SPINK4O60575 86 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 TOX4O94842 621 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 APELAP0DMC3 54 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 Q56UQ5 140 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 TCF24Q7RTU0 167 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 ZNF580Q9UK33 172 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 RNF114Q9Y508 228 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 C2orf70A6NJV1 201 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 H3BUA1 57 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 CHEK1O14757 476 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 LY6HO94772 140 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 GHRHP01286 108 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 CTSGP08311 255 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 KRTDAPP60985 99 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-215ENST00000530170 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms