RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 SS18L2Q9UHA2 77 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 BCL9O00512 1426 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 CST7O76096 145 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 RTL8BQ17RB0 113 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 FKBP1CQ5VVH2 108 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 CST11Q9H112 138 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 JPT1Q9UK76 154 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 FANCMQ8IYD8 2048 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A0J9YY99 117 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIAS1O75925 651 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF137PP52743 207 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPINK7P58062 85 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNG3P63215 75 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 Q6ZQY7 126 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 CROCCP2Q86T23 111 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 AP3S1Q92572 193 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLEKHB2Q96CS7 222 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUPR2A6NF83 97 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 MFSD11O43934 449 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCL4P13236 92 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 BASP1P80723 227 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZGRF1Q86YA3 2104 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 NEK7Q8TDX7 302 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 MCEEQ96PE7 176 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 RTL9Q8NET4 1388 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 CSN2P05814 226 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPINT3P49223 89 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 TCTAP57738 103 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIK3C2AO00443 1686 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 MUC5ACP98088 5654 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 H3BQV1 296 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 VMA21Q3ZAQ7 101 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 TPRKBQ9Y3C4 175 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 PDE6GP18545 87 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 KDELR1P24390 212 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 C6orf52Q5T4I8 152 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC00269Q8N2A0 174 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMIM20Q8N5G0 67 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 EFCAB11Q9BUY7 163 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 A6NN06 94 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 TAS2R41P59536 307 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 LTC4SQ16873 150 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 LYG2Q86SG7 212 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 C10orf111Q8N326 155 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 GRPEL2Q8TAA5 225 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR4C12Q96R67 309 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 UFC1Q9Y3C8 167 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT-ND6P03923 174 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 Q86TA4 180 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRR15Q8IV56 129 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 STX19Q8N4C7 294 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLAC4Q8WY50 150 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCL19Q99731 98 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 IL20Q9NYY1 176 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTPRDP23468 1912 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR4B1Q8NGF8 309 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 BORCS8Q96FH0 119 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 LIMD2Q9BT23 127 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 BIN3Q9NQY0 253 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 FRAS1Q86XX4 4008 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADGBQ8N7X0 1667 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGHV3-30P01768 117 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 FABP4P15090 132 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 GLRXP35754 106 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM24BQ8N5W8 94 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 C5orf17Q8NAS9 161 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCL4L1Q8NHW4 92 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 DIRC1Q969H9 104 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 ISOC1Q96CN7 298 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 BOLA2Q9H3K6 86 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 OTORQ9NRC9 128 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 MED11Q9P086 117 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 MYH2Q9UKX2 1941 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 CARD19Q96LW7 228 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 NAT8BQ9UHF3 227 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPTBP11277 2137 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CASC2Q6XLA1 102 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms