RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDUFB4O95168 129 aa13.87□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 RHOBP62745 196 aa13.87□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 C2CD4CQ8TF44 421 aa13.87□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 PAXXQ9BUH6 204 aa13.87□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRAC2D3DTV9 90 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 M0R2Z0 102 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR7C2O60412 319 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR10J4P0C629 311 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB2AP61019 212 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 FXYD5Q96DB9 178 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR51M1Q9H341 326 aa13.86□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARPC5O15511 151 aa13.85□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 M6PRP20645 277 aa13.85□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 KHDC3LQ587J8 217 aa13.85□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.85□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 M0R3E3 92 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 INSP01308 110 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 AMBPP02760 352 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP6V0CP27449 155 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 TAS2R45P59539 299 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 BAP18Q8IXM2 172 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 RNF141Q8WVD5 230 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF503Q96F45 646 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.84□□□□□ -0.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGLL5B9A064 214 aa13.83□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.83□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.83□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZTC4 211 aa13.83□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.83□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.83□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 SH3BGRL3Q9H299 93 aa13.83□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.83□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV10A0A0B4J240 114 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 NEU1Q99519 415 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 CELA1Q9UNI1 258 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRELID1Q9Y255 219 aa13.82□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13.81□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1W2PPV4 95 aa13.81□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 EMP1P54849 157 aa13.81□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCTAP57738 103 aa13.81□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 ICAM4Q14773 271 aa13.81□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.81□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM189A5PLL7 270 aa13.8□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.8□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.8□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF767PQ75MW2 155 aa13.8□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.8□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 HBE1P02100 147 aa13.79□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDKN1BP46527 198 aa13.79□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 SERF2P84101 59 aa13.79□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.79□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 TAAR5O14804 337 aa13.78□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 MBP02144 154 aa13.78□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF345Q14585 488 aa13.78□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.78□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 ODF3Q96PU9 254 aa13.78□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q9H3A6 140 aa13.78□□□□□ -0.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.77□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 CT45A10P0DMU9 189 aa13.77□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 TSPOP30536 169 aa13.77□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 RANP62826 216 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 ERCC8Q13216 396 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIR3DS1Q14943 382 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 RRN3P1Q2M238 152 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 C12orf74Q32Q52 190 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZNX1 250 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB24Q969Q5 203 aa13.76□□□□□ -0.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms