RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TSC22D2O75157 780 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 CCNKO75909 580 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE7O76087 117 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFB6O95139 128 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE12FP0CL80 117 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE12GP0CL81 117 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE12IP0CL82 117 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 RAB31Q13636 194 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TRIQKQ629K1 86 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0J9YY99 117 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 CENPXA8MT69 81 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 H3BNG1 76 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 LEPP41159 167 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZRG5 221 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1W2PPQ1 181 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 PRAC2D3DTV9 90 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 L7N2F9 121 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 VAMP2P63027 116 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 KIR3DS1Q14943 382 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GUK1Q16774 197 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ESRGQ1W209 222 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 Q9H3A6 140 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 C7orf66A4D0T2 115 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 H3BTX0 84 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 J3KRW8 73 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 HOXA5P20719 270 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 CAMLGP49069 296 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ARL16Q0P5N6 197 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF846Q147U1 533 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 OPCMLQ14982 345 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 Q8N1X5 172 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ODF3Q96PU9 254 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 UPK3BQ9BT76 320 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SRRQ9GZT4 340 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 H3BQ15 152 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 SLC17A3O00476 420 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 EREGO14944 169 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 CT45A10P0DMU9 189 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 IGLC2P0DOY2 106 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 BCAP31P51572 246 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 BAK1Q16611 211 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 MITD1Q8WV92 249 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 MGST2Q99735 147 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 PFDN5Q99471 154 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.31□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 CAV2P51636 162 aa8.31□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 MORN5Q5VZ52 161 aa8.31□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZTI0 123 aa8.31□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.31□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00477Q96M19 166 aa8.31□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.31□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 FAM25EA8MYX2 175 aa8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF253O75346 499 aa8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 CST7O76096 145 aa8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 MIC13Q5XKP0 118 aa8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 PRELID1Q9Y255 219 aa8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.3□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 A0A096LPF7 62 aa8.29□□□□□ -1.08
CNOT4-211ENST00000498534 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.29□□□□□ -1.08
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