RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 THAP8Q8NA92 274 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CST9LQ9H4G1 147 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PROK2Q9HC23 129 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 X6R8D5 127 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00473A8K010 186 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 RBP4P02753 201 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MORN2Q502X0 79 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 C8orf86Q6ZUL3 223 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCA1O95477 2261 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PGPA6NDG6 321 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 F5H697 171 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 BMPR1BO00238 502 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFS7O75251 213 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR82Q6UXN9 313 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6ZPA2 131 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TSKUQ8WUA8 353 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 V9GYV3 84 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 DOCK7Q96N67 2140 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MYOD1P15172 320 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 NPPCP23582 126 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LEPP41159 167 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRCDQ00LT1 54 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM200BQ69YZ2 307 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR82Q96P67 336 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CCL13Q99616 98 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PRO0628Q9UI54 55 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 NUPR1O60356 82 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LYNX1P0DP58 116 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 Q8TCH9 128 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LYZP61626 148 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SEC11AP67812 179 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FOXE3Q13461 319 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6YL49 198 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TCF24Q7RTU0 167 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 STPG4Q8N801 248 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FMC1Q96HJ9 113 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 CHD6Q8TD26 2715 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 DSCAMO60469 2012 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 UPK2O00526 184 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 FABP2P12104 132 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR183P32249 361 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 LEAP2Q969E1 77 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 B5MCH6 92 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 H3BS24 57 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 GNG5P63218 68 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 C2orf83Q53S99 150 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 MPV17L2Q567V2 206 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 PSMG4Q5JS54 123 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6AWC8 147 aa3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms