RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 OR4C46A6NHA9 309 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 OR10J4P0C629 311 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 PYYP10082 97 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ID1P41134 155 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 BLNKQ8WV28 456 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 FXYD5Q96DB9 178 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 GNG13Q9P2W3 67 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 DKK2Q9UBU2 259 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 MLXQ9UH92 298 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 COL6A5A8TX70 2615 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PRE2 83 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 TSPAN4O14817 238 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 BCL2P10415 239 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ISLRO14498 428 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV1-51P01701 117 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 EDN2P20800 178 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 CSN1S1P47710 185 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SUN5Q8TC36 379 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF503Q96F45 646 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 OTORQ9NRC9 128 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 PRELID1Q9Y255 219 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 K7EQM0 130 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 PDE6DO43924 150 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2G2P60604 165 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 GUCA2BQ16661 112 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 CST9LP1Q5W188 147 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 Q9H3A6 140 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 VAX2Q9UIW0 290 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 STAB1Q9NY15 2570 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 FAM74A7A6NL05 159 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 C11orf94C9JXX5 98 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 F6UZH7 168 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 H3BQ15 152 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 TFPI2P48307 235 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 RANP62826 216 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 FAM210AQ96ND0 272 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 MED9Q9NWA0 146 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 RAB19A4D1S5 217 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 GGTLC3B5MD39 225 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 H3BTX0 84 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 K7EQG2 157 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SLC17A3O00476 420 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SOCS3O14543 225 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 PAGE4O60829 102 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 PEA15Q15121 130 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFA5Q16718 116 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 HAGHQ16775 308 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF738Q8NE65 137 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 DCANP1Q8TF63 244 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-211ENST00000497210 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFB4O95168 129 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-211ENST00000497210 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-211ENST00000497210 IGLL1P15814 213 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-211ENST00000497210 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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