RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495426.1

BBS9-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 3

Gene BBS9, Length 481 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-213	ENST00000495426	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TRGV9	Q99603	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	RBKS	Q9H477	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		A0A087WTM6	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		A0A096LPF7	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	NXPH4	O95158	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	RAB3D	O95716	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	RLN2	P04090	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GPR82	Q96P67	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		H3BRN7	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		H7BYZ3	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	HPGDS	O60760	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	ORM2	P19652	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	CDKN1B	P46527	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TAS2R19	P59542	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	IAPP	P10997	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	CXCL3	P19876	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	S100A7	P31151	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	CCR6	P51684	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	RAB11A	P62491	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	PSG3	Q16557	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		Q6ZTI0	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		Q9H521	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		A0A087X0K7	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426		A0A0B4J2A0	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	NCS1	P62166	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	AKR1C4	P17516	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	OR5G3	P0C626	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	LINC00869	P0C866	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	AMT	P48728	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	VBP1	P61758	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	SRPX	P78539	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBS9-213	ENST00000495426	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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