RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 LINC01587Q99440 93 aa7.52□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.52□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.52□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 M0R2N4 97 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 M0R3E3 92 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 EREGO14944 169 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 DEFB130BP0DP73 79 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 DEFB130AP0DP74 79 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 CXCL2P19875 107 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 HBG1P69891 147 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 HBG2P69892 147 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 ERCC8Q13216 396 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 S100A7AQ86SG5 101 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 NACAE9PAV3 2078 aa7.51□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 NDUFB4O95168 129 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 CT45A10P0DMU9 189 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 CDKN1BP46527 198 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 ATP6V1FQ16864 119 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 BLNKQ8WV28 456 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 PFDN5Q99471 154 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 NMES1Q9C002 83 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 E5RGE8 158 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 PRAF2O60831 178 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 RLN2P04090 185 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 OXA1LQ15070 435 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 RNF24Q9Y225 148 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 SSNA1O43805 119 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 OR10J4P0C629 311 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 P0DMU3 169 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 FAM231AP0DMU4 169 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 FAM231CP0DMU5 169 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TSPOP30536 169 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TAS2R60P59551 318 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 LYRM9A8MSI8 78 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 F5H768 121 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 MPC2O95563 127 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZQT7 251 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 MBD2Q9UBB5 411 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.46□□□□□ -1.21
NELFE-213ENST00000494956 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 MPDU1O75352 247 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 DEFA1P59665 94 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 DEFA3P59666 94 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 CD300CQ08708 224 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 BTN1A1Q13410 526 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 ICAM4Q14773 271 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 GUK1Q16774 197 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 ZNF503Q96F45 646 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 C16orf74Q96GX8 76 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 WFDC1Q9HC57 220 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 HSPB11Q9Y547 144 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 H7BYZ3 331 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 RTL8CO15255 209 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 ZNF253O75346 499 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 GHRHP01286 108 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 PRR9Q5T870 116 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 FXYD5Q96DB9 178 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 ATP5SQ99766 215 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 VGLL1Q99990 258 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 OR51M1Q9H341 326 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
NELFE-213ENST00000494956 ALG5Q9Y673 324 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms