RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa12.91□□□□□ -0.34
TOM1-216ENST00000492723 F2Z2F3 143 aa12.91□□□□□ -0.34
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TOM1-216ENST00000492723 ZNF253O75346 499 aa12.91□□□□□ -0.34
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TOM1-216ENST00000492723 SLAQ13239 276 aa12.91□□□□□ -0.34
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TOM1-216ENST00000492723 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa12.88□□□□□ -0.35
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TOM1-216ENST00000492723 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.87□□□□□ -0.35
TOM1-216ENST00000492723 RNF182Q8N6D2 247 aa12.87□□□□□ -0.35
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TOM1-216ENST00000492723 PRR31Q5SQ13 230 aa12.87□□□□□ -0.35
TOM1-216ENST00000492723 DNLZQ5SXM8 178 aa12.87□□□□□ -0.35
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TOM1-216ENST00000492723 PAFAH1B2P68402 229 aa12.83□□□□□ -0.35
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TOM1-216ENST00000492723 TENM4Q6N022 2769 aa12.83□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
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TOM1-216ENST00000492723 C18orf32Q8TCD1 76 aa12.82□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.82□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 COX8CQ7Z4L0 72 aa12.82□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 TMEM189A5PLL7 270 aa12.81□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 HAX1O00165 279 aa12.81□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 FSHBP01225 129 aa12.81□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 GLMPQ8WWB7 406 aa12.81□□□□□ -0.36
TOM1-216ENST00000492723 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
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