RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 BCORQ6W2J9 1755 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T1O43869 369 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5G3P48201 142 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N2B8 174 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 PYCARDQ9ULZ3 195 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 CCNB3Q8WWL7 1395 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 PROSCO94903 275 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 IL9P15248 144 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00311Q8N616 119 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T10Q8NGZ9 312 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 HS3ST2Q9Y278 367 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 HECTD1Q9ULT8 2610 aa2.68□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 DMXL1Q9Y485 3027 aa2.67□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 UBL3O95164 117 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 BRS3P32247 399 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 RRN3P1Q2M238 152 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 YPEL2Q96QA6 119 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 REG4Q9BYZ8 158 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 TRABDQ9H4I3 376 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 IL20Q9NYY1 176 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 MICAL3Q7RTP6 2002 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 DNHD1Q96M86 4753 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 MYOFQ9NZM1 2061 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 RGPD5Q99666 1765 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 RELNP78509 3460 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 ATG12O94817 140 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 C1QBP02746 253 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 RHOGP84095 191 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 FBN2P35556 2912 aa2.66□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 MYO9AB2RTY4 2548 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 OR1I1O60431 355 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 BRMS1LQ5PSV4 323 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZSA8 131 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRC-212ENST00000491302 OR10J5Q8NHC4 309 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 AP3S1Q92572 193 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 MED13Q9UHV7 2174 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 CEP162Q5TB80 1403 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-212ENST00000491302 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-212ENST00000491302 SSR2P43308 183 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 CEP250Q9BV73 2442 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 ALPK2Q86TB3 2170 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 DMDP11532 3685 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-212ENST00000491302 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf70A6NJV1 201 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFC2O95298 119 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 ANGP03950 147 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 NCALDP61601 193 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 PDE6HQ13956 83 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 TEX47Q8TBZ9 253 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 SLAMF6Q96DU3 332 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 SNURFQ9Y675 71 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 DENND4CQ5VZ89 1909 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRC-212ENST00000491302 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 G3V2T6 193 aa2.62□□□□□ -1.99
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PTPRC-212ENST00000491302 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 POU6F1Q14863 301 aa2.62□□□□□ -1.99
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PTPRC-212ENST00000491302 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf105Q8TEF2 133 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 FRYQ5TBA9 3013 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 MYH7BA7E2Y1 1941 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP46Q8IYW2 2715 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 SPTBN2O15020 2390 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-212ENST00000491302 OBSL1O75147 1896 aa2.61□□□□□ -1.99
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