RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PYYP10082 97 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TSPOP30536 169 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q6ZTC4 211 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FUT9Q9Y231 359 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LY6G6CO95867 125 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CDKN1BP46527 198 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR51M1Q9H341 326 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CELA1Q9UNI1 258 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRELID1Q9Y255 219 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR7C2O60412 319 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC01587Q99440 93 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PAXXQ9BUH6 204 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGLL5B9A064 214 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRAC2D3DTV9 90 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TCTAP57738 103 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TAS2R45P59539 299 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF266Q14584 549 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C12orf74Q32Q52 190 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WFDC1Q9HC57 220 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NDUFB4O95168 129 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR10J4P0C629 311 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LEPP41159 167 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KHDC3LQ587J8 217 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNF141Q8WVD5 230 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AQP10Q96PS8 301 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 M0R3E3 92 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HTN1P15515 57 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ICAM4Q14773 271 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OXA1LQ15070 435 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DKK2Q9UBU2 259 aa14.17□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1W2PPV4 95 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 M6PRP20645 277 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TAS2R60P59551 318 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FXYD5Q96DB9 178 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ODF3Q96PU9 254 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 H7BYZ3 331 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 J3KRW8 73 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CSN1S1P47710 185 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CT45A10P0DMU9 189 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DAD1P61803 113 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC00477Q96M19 166 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RANP62826 216 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ERCC8Q13216 396 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q5BKY6 102 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C16orf74Q96GX8 76 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LYRM9A8MSI8 78 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRM2P04554 102 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RAB2AP61019 212 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MBP02144 154 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HTN3P15516 51 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms