RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 TNFP01375 233 aa-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 PDE6GP18545 87 aa-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 VBP1P61758 197 aa-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 TPM4P67936 248 aa-0.63□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 IMPG1Q17R60 797 aa-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.63□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.64□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 H3F3AP84243 136 aa-0.64□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 IFNA7P01567 189 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 Q5VSD8 79 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 CFAP53Q96M91 514 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 ASB4Q9Y574 426 aa-0.69□□□□□ -2.52
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