RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 SNURFLB1AK76 121 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 MBPP02686 304 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 IGLC2P0DOY2 106 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF846Q147U1 533 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 RXFP4Q8TDU9 374 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 ODF3Q96PU9 254 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 PRAC2D3DTV9 90 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 H3BNG1 76 aa15.4■□□□□ 0.06
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PTPRN-215ENST00000484986 CAMLGP49069 296 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 KIR3DS1Q14943 382 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 OPCMLQ14982 345 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRN-215ENST00000484986 SLC17A3O00476 420 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 BTCP35070 178 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 OR1L4Q8NGR5 311 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
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PTPRN-215ENST00000484986 GAGE12IP0CL82 117 aa15.38■□□□□ 0.05
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PTPRN-215ENST00000484986 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 A0A0J9YY99 117 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 A0A1W2PPQ1 181 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF253O75346 499 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 CT45A10P0DMU9 189 aa15.36■□□□□ 0.05
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PTPRN-215ENST00000484986 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
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PTPRN-215ENST00000484986 C20orf85Q9H1P6 137 aa15.35■□□□□ 0.05
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PTPRN-215ENST00000484986 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.34■□□□□ 0.05
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PTPRN-215ENST00000484986 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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PTPRN-215ENST00000484986 RPL29P47914 159 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV5A0A0B4J249 113 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 C5orf51A6NDU8 294 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 VWC2Q2TAL6 325 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa15.32■□□□□ 0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 TRGV2A0A075B6R0 118 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 S100A11P31949 105 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 Q6ZTI0 123 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 C18orf15Q96N68 181 aa15.31■□□□□ 0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 C7orf71A4D174 169 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 SULT1A1P50225 295 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 HBG1P69891 147 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 HBG2P69892 147 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 BAXQ07812 192 aa15.3■□□□□ 0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 STX12Q86Y82 276 aa15.3■□□□□ 0.04
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PTPRN-215ENST00000484986 LINC00477Q96M19 166 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM14CQ9P0S9 112 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 APOBP04114 4563 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 DNAH5Q8TE73 4624 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 LYRM1O43325 122 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRN-215ENST00000484986 TCRBP04435 133 aa15.29■□□□□ 0.04
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