RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 VGLL1Q99990 258 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GGACTQ9BVM4 153 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 VSIRQ9H7M9 311 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GV50 99 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01619G3V211 115 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TAAR5O14804 337 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IL4P05112 153 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR5G3P0C626 314 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00869P0C866 280 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FHITP49789 147 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RAB2AP61019 212 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF616Q08AN1 781 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RAB31Q13636 194 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF266Q14584 549 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RPEL1Q2QD12 228 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 LEMD1Q68G75 181 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PATE2Q6UY27 113 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF709Q8N972 641 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 Q8WTZ3 238 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TRGV9Q99603 122 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TXN2Q99757 166 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CITED1Q99966 193 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SNURFLB1AK76 121 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FNDC10F2Z333 226 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CDK2AP2O75956 126 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 B2MP61769 119 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZRG5 221 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 MIR17HGQ75NE6 70 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SSX7Q7RTT5 188 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SLC51BQ86UW2 128 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 BAP18Q8IXM2 172 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PRAC1Q96KF2 57 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GINS3Q9BRX5 216 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ARV1Q9H2C2 271 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A22Q9H936 323 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RPRMQ9NS64 109 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 STAB1Q9NY15 2570 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM213A2RRL7 107 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TEX46H3BTG2 121 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 H3BTX0 84 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA4O00483 81 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 COX7A2P2O60397 106 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MPDU1O75352 247 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 HYPMO75409 117 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FABP1P07148 127 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 C4BPBP20851 252 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZP3P21754 424 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 NPPCP23582 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MYCNOSP40205 109 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 DSCR10P59022 87 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SSTP61278 116 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IFITM2Q01629 132 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FAM78BQ5VT40 261 aa3.52□□□□□ -1.85
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