RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479433.5

FBXO18-211, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 527 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-211ENST00000479433 ODF3Q96PU9 254 aa4.43□□□□□ -1.7
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FBXO18-211ENST00000479433 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.43□□□□□ -1.7
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FBXO18-211ENST00000479433 ZNF253O75346 499 aa4.42□□□□□ -1.7
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FBXO18-211ENST00000479433 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
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FBXO18-211ENST00000479433 GAGE12GP0CL81 117 aa4.39□□□□□ -1.71
FBXO18-211ENST00000479433 GAGE12IP0CL82 117 aa4.39□□□□□ -1.71
FBXO18-211ENST00000479433 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
FBXO18-211ENST00000479433 M6PRP20645 277 aa4.39□□□□□ -1.71
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