RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ICAM4Q14773 271 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 TUBA4BQ9H853 241 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-210ENST00000477812 A8MTW9 85 aa14.69□□□□□ -0.06
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ACTB-210ENST00000477812 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTB-210ENST00000477812 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-210ENST00000477812 AMTNQ6UX39 209 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTB-210ENST00000477812 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-210ENST00000477812 HAGHQ16775 308 aa14.63□□□□□ -0.07
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ACTB-210ENST00000477812 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-210ENST00000477812 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-210ENST00000477812 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.58□□□□□ -0.08
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ACTB-210ENST00000477812 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 UBE2CO00762 179 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 NMBP08949 121 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 CST9LP1Q5W188 147 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-210ENST00000477812 ASCL2Q99929 193 aa14.57□□□□□ -0.08
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