RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 PRAC2D3DTV9 90 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 E5RGE8 158 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 F5H768 121 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 PET100P0DJ07 73 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 CXCL2P19875 107 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 S100A11P31949 105 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 CDKN1BP46527 198 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 SULT1A1P50225 295 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 IGSF23A1L1A6 192 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 H3BQ15 152 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 NUDT3O95989 172 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 KIR3DS1Q14943 382 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 RGS21Q2M5E4 152 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 ATG101Q9BSB4 218 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 ALG5Q9Y673 324 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 FGF7P21781 194 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 TSPOP30536 169 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 H2BFSP57053 126 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 TAS2R60P59551 318 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 ATP6V1FQ16864 119 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 C16orf74Q96GX8 76 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 PFDN5Q99471 154 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 MED28Q9H204 178 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 HERC2O95714 4834 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 PKHD1P08F94 4074 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 RTL8CO15255 209 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 ATP5G1P05496 136 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 IGLC2P0DOY2 106 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 ATP5G3P48201 142 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 RNF212Q495C1 297 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-212ENST00000468164 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 H7BYZ3 331 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 BLNKQ8WV28 456 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 GUK1Q16774 197 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 VWC2Q2TAL6 325 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 THAP6Q8TBB0 222 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 CBY3A6NI87 242 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 SNURFLB1AK76 121 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 M0R3E3 92 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 MPDU1O75352 247 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 MPC2O95563 127 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 CT45A10P0DMU9 189 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 PYYP10082 97 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 LEPP41159 167 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 NHLH2Q02577 135 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 OR5I1Q13606 314 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GVY2 172 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE12BA1L429 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 H0YIZ8 118 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE7O76087 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE12FP0CL80 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE12GP0CL81 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE12IP0CL82 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 ERCC8Q13216 396 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 CLINT1Q14677 625 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 MBD2Q9UBB5 411 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 MUC4Q99102 2169 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZR54 194 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 RNF141Q8WVD5 230 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0J9YY99 117 aa9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.5 ms