RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466662.1

PNCK-223, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 3

Gene PNCK, Length 464 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-223	ENST00000466662	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	NDUFB4	O95168	129 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	RRN3P1	Q2M238	152 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	C12orf74	Q32Q52	190 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	FUT9	Q9Y231	359 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	CDKN1B	P46527	198 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	TCTA	P57738	103 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662		M0R3E3	92 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	EMP1	P54849	157 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	OXA1L	Q15070	435 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	AQP10	Q96PS8	301 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	OR51M1	Q9H341	326 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	PRELID1	Q9Y255	219 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	BLNK	Q8WV28	456 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	FXYD5	Q96DB9	178 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	ODF3	Q96PU9	254 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	LY6G6C	O95867	125 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	TSPO	P30536	169 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662		Q5BKY6	102 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	PAXX	Q9BUH6	204 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PNCK-223	ENST00000466662	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	IGLL5	B9A064	214 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	OR7C2	O60412	319 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	ZNF266	Q14584	549 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	RNF141	Q8WVD5	230 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	ZNF503	Q96F45	646 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	OR10J4	P0C629	311 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	ICAM4	Q14773	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	KHDC3L	Q587J8	217 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	APLN	Q9ULZ1	77 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	PRM2	P04554	102 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	CT45A10	P0DMU9	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	M6PR	P20645	277 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	TAS2R45	P59539	299 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	TAS2R60	P59551	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	LINC01587	Q99440	93 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662		H7BYZ3	331 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	LEP	P41159	167 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	RNF222	A6NCQ9	220 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662		G3V3Q6	166 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	AZU1	P20160	251 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	LYRM9	A8MSI8	78 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	RAB2A	P61019	212 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	ERCC8	Q13216	396 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	C16orf74	Q96GX8	76 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNCK-223	ENST00000466662	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PNCK-223	ENST00000466662	KLLN	B2CW77	178 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PNCK-223	ENST00000466662	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.77	□□□□□ -0.37
PNCK-223	ENST00000466662	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PNCK-223	ENST00000466662	CRISP2	P16562	243 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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