RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-204	ENST00000466539	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539		A0A1W2PPV4	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539		H3BQ15	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	CD28	P10747	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	ORM2	P19652	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	NPPC	P23582	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TAS2R45	P59539	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	LYZ	P61626	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	RARRES2	Q99969	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	LINC01619	G3V211	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	CHEK1	O14757	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	CRYBA1	P05813	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	PYY	P10082	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	ZP3	P21754	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	MEOX2	P50222	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TWIST1	Q15672	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539		A8MTW9	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	PDE6D	O43924	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	CSN3	P07498	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	S100A7	P31151	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	HAGH	Q16775	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	METTL26	Q96S19	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	DOK5	Q9P104	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	SORL1	Q92673	2214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539		A0A1W2PS18	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539		C9JCJ5	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	SLC17A3	O00476	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	PAGE4	O60829	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	IFNA1	P01562	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	EDN2	P20800	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	CBLN1	P23435	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	ATP5G3	P48201	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	PEA15	Q15121	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSME4-204	ENST00000466539	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms