RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	AMTN	Q6UX39	209 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902		X6R8D5	127 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	TENM2	Q9NT68	2774 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902		A8MTW9	85 aa		12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	AMBP	P02760	352 aa		12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	ICAM4	Q14773	271 aa		12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902		Q8NAQ8	132 aa		12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	FXYD5	Q96DB9	178 aa		12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902		M0R3E3	92 aa		12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	PRELID1	Q9Y255	219 aa		12.85	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	INS	P01308	110 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	ZNF503	Q96F45	646 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	RYR2	Q92736	4967 aa		12.84	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	TAAR5	O14804	337 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	MB	P02144	154 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	SERF2	P84101	59 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		12.83	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	JTB	O76095	146 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	HBE1	P02100	147 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	EMP1	P54849	157 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		12.82	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902		J3KRW8	73 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	TSPO	P30536	169 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	CDKN1B	P46527	198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	NEU1	Q99519	415 aa		12.81	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	HMSD	A8MTL9	139 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	CSN1S1	P47710	185 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	ERCC8	Q13216	396 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	RRN3P1	Q2M238	152 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZNX1	250 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	RAB24	Q969Q5	203 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902		Q9H3A6	140 aa		12.8	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	CT45A10	P0DMU9	189 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	HTN1	P15515	57 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	LEP	P41159	167 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	HYLS1	Q96M11	299 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	LINC01587	Q99440	93 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	LYST	Q99698	3801 aa		12.79	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902		A0A0D9SG52	128 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	NUPR2	A6NF83	97 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	ZNF345	Q14585	488 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		12.78	□□□□□ -0.36
USP19-210	ENST00000465902	LCE6A	A0A183	80 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	PGP	A6NDG6	321 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	PFDN1	O60925	122 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	PRM2	P04554	102 aa		12.77	□□□□□ -0.37
USP19-210	ENST00000465902	STAG3L2	P0CL84	134 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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