RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 WDR73Q6P4I2 378 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 OR11H2Q8NH07 326 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 MITD1Q8WV92 249 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 SMIM8Q96KF7 97 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 CCDC32Q9BV29 185 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GGACTQ9BVM4 153 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.06□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 TMEM189A5PLL7 270 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 A8MTW9 85 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 H3BMM0 161 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 WRBO00258 174 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 SOCS3O14543 225 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 AMBPP02760 352 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 HOXB5P09067 269 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF688P0C7X2 276 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 HLA-DMBP28068 263 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 BTCP35070 178 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GALR1P47211 349 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 KRTAP10-1P60331 282 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 DLK1P80370 383 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF90Q03938 601 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 PSMG4Q5JS54 123 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 LEMD1Q68G75 181 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 Q8NAQ8 132 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 S100ZQ8WXG8 99 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.05□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 A0A087X0K7 114 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF98A6NK75 572 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 PLA2G10O15496 165 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 LYRM1O43325 122 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 HYPMO75409 117 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ADAP1O75689 374 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GAGE7O76087 117 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 TCRBP04435 133 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GAGE12FP0CL80 117 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GAGE12GP0CL81 117 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GAGE12IP0CL82 117 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 P0DMU3 169 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 FAM231AP0DMU4 169 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 FAM231CP0DMU5 169 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 IAPPP10997 89 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 CXCL2P19875 107 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 LYZP61626 148 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 B2MP61769 119 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 AKR1C1Q04828 323 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GAGE1Q13065 139 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 GAGE4Q13068 117 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF846Q147U1 533 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 OXA1LQ15070 435 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 LELP1Q5T871 98 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF546Q86UE3 836 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 FAM210BQ96KR6 192 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 RPRMQ9NS64 109 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 PSENENQ9NZ42 101 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.04□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.03□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 A0A0J9YX75 114 aa3.03□□□□□ -1.92
CNN3-204ENST00000461018 C7orf66A4D0T2 115 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms