RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.58□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.58□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.58□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1B0GV50 99 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 KNCNA6PVL3 124 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 A8MZ25 164 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 F6UB75 175 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 M0R3E3 92 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 RANP62826 216 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 DEFA6Q01524 100 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ICAM4Q14773 271 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF738Q8NE65 137 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 Q9H3A6 140 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.57□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 PRAC2D3DTV9 90 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 HLA-DRB4P13762 266 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 CCL20P78556 96 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 OTORQ9NRC9 128 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 PRELID1Q9Y255 219 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0J9YX75 114 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PRE2 83 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 FAM74A7A6NL05 159 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 GGTLC3B5MD39 225 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 H3BMM0 161 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 HBE1P02100 147 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 MRAPQ8TCY5 172 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 PGPA6NDG6 321 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 A8MTW9 85 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 IFNA7P01567 189 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2G2P60604 165 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 BLOC1S1P78537 153 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 IFITM2Q01629 132 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 STHQ8IWL8 128 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 TUBA4BQ9H853 241 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 AGRNO00468 2067 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 DIRC3C9JPN6 131 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 TEX46H3BTG2 121 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 PAGE4O60829 102 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 PPT1P50897 306 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 PMS2P11Q13670 270 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 GNG13Q9P2W3 67 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.53□□□□□ -1.2
GARNL3-211ENST00000460176 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV3-20P01619 116 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 NMBP08949 121 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ATP5G3P48201 142 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 GNG5P63218 68 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 AMTNQ6UX39 209 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 MANBALQ9NQG1 85 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 EPDR1Q9UM22 224 aa7.52□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TCRAP04437 139 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms