RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	PRAF2	O60831	178 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ANXA3	P12429	323 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TNFSF8	P32971	234 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	AKR1D1	P51857	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	AP3S1	Q92572	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	LRP2	P98164	4655 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504		J3KRW8	73 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504		K7EP13	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SCO1	O75880	301 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	CDKN1B	P46527	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	ID3	Q02535	119 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504		V9GYH0	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	LECT2	O14960	151 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	ATG12	O94817	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	PGAM2	P15259	253 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TAS2R46	P59540	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	PSG3	Q16557	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SP6	Q3SY56	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	MED28	Q9H204	178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504		E5RGE8	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	PI3	P19957	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	HRH1	P35367	487 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SCAND1	P57086	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB5B	P61020	215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	WFDC2	Q14508	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A0A6YYH2	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504		A6NJ64	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	LYRM1	O43325	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	GYPE	P15421	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	ORM2	P19652	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SRI	P30626	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	SDC2	P34741	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	CRYBA4	P53673	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	MXD1	Q05195	221 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HDLBP-222	ENST00000449504	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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