RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SSX7Q7RTT5 188 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 RAB24Q969Q5 203 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 LINC00052Q96N35 136 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 FUT9Q9Y231 359 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 ZNF98A6NK75 572 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 H3BRN7 92 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 ID1P41134 155 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 GALR1P47211 349 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 LCN15Q6UWW0 184 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 APLNQ9ULZ1 77 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 NMBP08949 121 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 MIFP14174 115 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 BLOC1S1P78537 153 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 S100A7AQ86SG5 101 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 C16orf92Q96LL3 132 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 OR7C2O60412 319 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 IGKV3-20P01619 116 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 P0DMU3 169 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 FAM231AP0DMU4 169 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 FAM231CP0DMU5 169 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R45P59539 299 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 DEFB1P60022 68 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 KHDC3LQ587J8 217 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.46□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 TEX46H3BTG2 121 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 CXorf1O96002 111 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 HBE1P02100 147 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 STAG3L2P0CL84 134 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 STAG3L3P0CL85 134 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 PSMB3P49720 205 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 CLLU1Q5K131 121 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 GPR82Q96P67 336 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.45□□□□□ -1.06
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PRAME-210ENST00000442481 PYYP10082 97 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DMBP28068 263 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 GCHFRP30047 84 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 MEOX2P50222 304 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 PAXXQ9BUH6 204 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 OR51M1Q9H341 326 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 RNF24Q9Y225 148 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 F6UB75 175 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 ISLRO14498 428 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 SOCS3O14543 225 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 AMBPP02760 352 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 OR10J4P0C629 311 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 FXYD7P58549 80 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 CCL20P78556 96 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 RNF182Q8N6D2 247 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 Q8NAQ8 132 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 ZNF503Q96F45 646 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 H3BMM0 161 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 H3BTX0 84 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DRB4P13762 266 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 BLNKQ8WV28 456 aa8.43□□□□□ -1.06
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